Năm U.C.0094, trong một khu vực biên giới của vũ trụ, nơi đang tiến hành thử nghiệm khả năng chiến đấu của Delta Kai.MS này được được trang bị hệ thống N.I.T.R.O, hoặc là Newtype Injection Trace Reformed Oldtype, một thiết bị psycommu cho phép phi công bình thường có thể thể hiện ra các khả năng của một Newtype. Việc này cũng giúp cho nó điều khiển được các Prototype Fin Funnel mà nó mang theo. Cỗ máy này chạm trán với MSN-001A1 Delta Plus và sau đó đã đánh bại nó trong trận chiến, tuy nhiên ngay đó, có một kẻ thù mới xuất hiện....